Hola @jhonger
Sí, pueden ser iguales, pero lo más conveniente es distinguir entre nombre de la empresa y marca comercial, porque cumplen funciones diferentes.
Fijate que es muy conveniente para un negocio pequeño porque simplifica la comunicación y evita tener que posicionar dos nombres diferentes.
Claro, después puedes ir sumando otras marcas.
Lo importante es que antes de decidir el nombre compruebes su disponibilidad legal y marcaria en donde vas a operar, porque un nombre puede que esté libre como empresa, pero no significa necesariamente que esté disponible como marca.